De la siguiente manera podrán quitar (truncar) la fechas para quitarles los microsegundos.

–Como Quedaria sin los microsegundos

SELECT
CampoFecha
,DATEADD(MILLISECOND,
–DATEPART(MILLISECOND ,
CampoFecha
)
,
CampoFecha
)
as Resultado From Tabla

 

–Update de la Tabla

update Tabla set
CampoFecha=DATEADD(MILLISECOND,
–DATEPART(MILLISECOND ,
CampoFecha
)
,
CampoFecha
)